Seiten in joomla nicht mehr erreichbar nach Verzeichnisschutz bei 1und1

Ich wollte für die folgende Seite (ein joomla Projekt) mal einen Verzeichnisschutz bei 1und1 ausprobieren: http://www.korrekt-gera.de/
Danach funktionierte jedoch nix mehr. Die Startseite ist zwar noch erreichbar jedoch keine andere Seite mehr über einen Link in der Navigation. Außerdem gibt es Probleme im Adminbereich bei der Darstellung der Artikel.
Offensichtlich hängt dies mit dem Verzeichnisschutz bei 1und1 zusammen. Nach stundenlangen Gesprächen mit 1und1 gab es auch keine Lösung. Nach weiteren Stunden der Fehlersuche bemerkte ich, dass die .htaccess überschrieben wurde. Da aber auch joomla einiges aus der .htaccess holt, passt dann natürlich nix mehr. Wenn man den Verzeichnisschutz wieder entfernt, wird die .htaccess sogar ganz gelöscht. Das Hochladen der .htaccess Datei funktioniert so auch nicht. Man muss eine htaccess.txt hoch laden und dann wieder in .htaccess umbenennen. Danach lief auch wieder alles glatt im joomla Projekt.